单细胞转录组数据伪时间轨迹的分析方法及计算机系统
公开
摘要
本发明公开了一种单细胞转录组数据伪时间轨迹的分析方法及计算机系统，其包括：1)计算基因显式比较优势矩阵；2)利用相似度得到基因相识度矩阵，构建基因网络；3)在基因网络中取初始节点，并从初始节点开始随机行走，记录走过的每一个基因，形成由基因序列构成的基因文本；4)将基因文本转换成基因的词向量；5)将单细胞表达的基因矢量以表达量为权重加和，形成的和矢量作为该单细胞在基因空间中的词向量表示；6)将所有的细胞的矢量表示进行可视化处理，得到胚胎细胞发育伪时间轨迹结果。本发明为鉴别组织中不同的稀有细胞亚型和不同细胞亚型的变异基因提供分析基础，在肿瘤、发育生物学、生命科学等领域有广泛重要的应用前景。
基本信息
专利标题 ：
单细胞转录组数据伪时间轨迹的分析方法及计算机系统
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114613433A
申请号 ：
CN202210279806.3
公开（公告）日 ：
2022-06-10
申请日 ：
2022-03-21
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
卢雨儿林海胡桓戚德振刘东东杨国钰邱野帅建伟
申请人 ：
国科温州研究院（温州生物材料与工程研究所）
申请人地址 ：
浙江省温州市龙湾区永中街道金联路1号
代理机构 ：
温州金瓯专利事务所(普通合伙)
代理人 ：
陈晖
优先权 ：
CN202210279806.3
主分类号 ：
G16B25/10
IPC分类号 ：
G16B25/10
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B25/00
特别适用于杂交的ICT；特别适用于基因或蛋白表达的ICT
G16B25/10
基因或蛋白质表达分型；表示比率估计或标准化
法律状态
2022-06-10 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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