本发明公开了一种基于张量随机游走的关键蛋白质识别方法,包括以下步骤：获取蛋白质相互作用网络拓扑结构、蛋白质结构域信息、基于时间序列的基因表达信息以及蛋白质同源信息；根据上述信息，建立蛋白质节点相互作用中不同蛋白质节点间的关联关系；根据所述蛋白质同源信息对蛋白质节点的枢纽得分进行初始化；以蛋白质相互作用中不同蛋白质节点间的关联关系建立张量模型；基于所述张量模型进行迭代计算得到每个蛋白质节点的枢纽得分并进行排序，将序列排行前n个蛋白质节点作为关键蛋白质。本发明简单有效，通过与其他方法比较，及在多个数据集上测试表明，该发明在关键蛋白质识别方面具有较好的预测性能。