本实用新型公开了一种浮游植物扫描电镜样品前处理器，包括处理器主体，所述处理器主体顶部设有增压器，所述增压器底部设有进样管，所述进样管底部连接有样品固定管，所述样品固定管外部套设有冷冻室，所述样品固定管底部连接有半渗透管，所述半渗透管固定设在脱水层中，所述脱水层顶部设有不同浓度脱水剂层，所述不同浓度脱水剂层底部设有纯水层，所述纯水层底部设有10%酒精层，所述10%酒精层底部设有30%酒精层。本实用新型结构科学合理，使用安全方便，通过设置样品固定室、冷冻室和脱水层，使扫描电镜样品的前处理过程简便、自动化且可控制，大大方便样品的处理；通过设置半渗透管，使浮游植物扫描电镜样品前处理器结构更可靠。