本发明实施例提供一种车辆移交跨区域重叠区的方法，包括在目标车辆完全驶离第一计轴进入第二计轴后，若移交区域控制器接收到第一计算机联锁发送的第一计轴由占用状态变为空闲状态的触发信号，且接收到接管区域控制器发送的第二计轴空闲状态信号，则保持第一计轴的占用状态；若移交区域控制器接收到接管区域控制器发送的第二计轴占用状态信号，则将第一计轴设置为空闲状态，使得根据第一计轴和第二计轴的状态控制目标车辆通过所述重叠区。本发明解决了移交区域控制器接收的第一计算机联锁发送的计轴区段占用状态和接管区域控制器发送的计轴区段占用状态延时不一致，所带来计轴区段占用状态不连续的问题，为列车在重叠区之间顺利移交提供了保证。