一种分泌型小蛋白的预测和聚类方法
实质审查的生效
摘要
本发明公开了一种分泌型小蛋白的预测和聚类方法。本发明的一种分泌型小蛋白的预测和聚类方法，包括如下步骤：(8)对于已分好组的SSP家族候选基因，使用非加权组平均法构建分组聚类树；(3)对拟南芥SSP家族基因的SSP家族motif使用邻接法构建进化树；(4)构建分组聚类树的软件为Mega7(Kumar et al.,2016)，聚类树编辑使用网页版软件；(5)观察聚类结果，并将聚在同一枝的组标注为一类；对于所有SSP家族候选基因，同样使用公式(8)和公式(8)计算两两之间的距离，绘制热图，并使用UPGMA方法进行聚类。本发明为基因预测，分类和进化分析提供了有用的工具。
基本信息
专利标题 ：
一种分泌型小蛋白的预测和聚类方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114334002A
申请号 ：
CN202011049412.6
公开（公告）日 ：
2022-04-12
申请日 ：
2020-09-29
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
郑波张哲施雪萍谢琪刘磊韩梦壮
申请人 ：
华中农业大学
申请人地址 ：
湖北省武汉市洪山区华中农业大学第三综合楼
代理机构 ：
北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人 ：
张换君
优先权 ：
CN202011049412.6
主分类号 ：
G16B30/00
IPC分类号 ：
G16B30/00 G16B40/00
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B30/00
特别适用于对核酸或氨基酸进行序列分析的ICT
法律状态
2022-04-29 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 30/00
申请日 : 20200929
申请日 : 20200929
2022-04-12 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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