本实用新型涉及除尘装置技术领域，且公开了一种用于测序芯片的除尘装置，解决了一般在对测序芯片除尘的过程中，在除尘完成后测序芯片仍然含有一定的灰尘，故除尘效果较差的问题，其包括工作台和上箱体，所述上箱体位于工作台的顶端，工作台的中部固定安装有下箱体，下箱体的中部固定安装有隔板，下箱体的一侧内壁固定安装有L形板，L形板上等距开设有圆孔，且L形板与下箱体之间形成吸附腔体，下箱体的一侧外壁固定安装有风机；本实用新型，通过设置的风刀、风机、真空泵和吸盘等的配合使用，配合正极板和负极板的使用，能够降低芯片本体对灰尘的吸附力，达到良好的除尘效果，同时能够避免对芯片本体造成损伤。