本发明公开了基于速率理论的锆基合金辐照损伤软件仿真系统及方法，涉及计算机仿真技术领域，其技术方案要点是：包括计算模块和GUI模块；计算模块包括数据库、函数单元、调用单元、运行单元；GUI模块包括输入单元、可视化单元。本发明可以替代昂贵的辐照试验和辐照后检验，模拟锆合金包壳在核电站的运行工况下材料中辐照缺陷的演化过程，该软件仿真系统可以模拟辐照缺陷引起的材料物理性能和力学性能的变化，定量计算中子辐照下材料辐照生长以及辐照硬化的变化，允许用户使用图形用户界面以最直观的方式设定模拟计算初始条件，允许用户根据对计算过程的要求和实验数据来改变模型参数建立数学建模，可实时监控模拟过程。