本发明公开了基于团簇动力学的锆基合金辐照损伤软件仿真系统及方法，涉及计算机仿真技术领域，其技术方案要点是：包括团簇动力学模拟模块、计算控制模块和GUI模块；团簇动力学模拟模块包括数学模型单元、文件生成单元；计算控制模块包括并行处理单元、实时监控单元、数据处理单元；GUI模块包括输入单元、可视化单元。本发明不仅可以研究辐照产生的点缺陷形成点缺陷团簇的过程，还可以模拟缺陷阱对团簇生长动力学的影响。本发明将团簇动力学模型集成到一个专用平台上，以便在一个平台的框架内，实现模型建立与计算、数据存储、数据处理以及结果可视化。