本发明公开了一种基于SN曲线的程序载荷谱编制方法，包括：获得构件的应力‑载荷函数关系，转化为等效应力谱再转化为第一指定形式雨流矩阵；外推计算得到最大应力幅值和第二指定形式的外推雨流矩阵；将外推后应力幅值和应力均值的二维应力谱等效为均值为0的一维应力谱；反推计算出每一级应力幅值；将所述一维应力谱进行分级，完成随机应力谱载荷的分级；将每一级的应力幅值换算为载荷幅值，得到一维的程序载荷谱；指定程序块循环次数，确定载荷块中每一级载荷的次数，对载荷程序块进行指定排列，完成程序载荷的编制。本发明还公开了一种基于SN曲线的程序载荷谱编制系统和一种用于执行基于SN曲线的程序载荷谱编制方法中步骤的计算机可读存储介质。