本发明公开了一种海底沉积层无扰动深尺度取样系统，该系统包括取样管机构，所述取样管机构包括导向花管、重锤、取样管、内衬管、花瓣式弹片组件以及刀口；下放回收机构，所述下放回收机构包括与所述重锤相连的缆绳；所述下放回收机构通过所述缆绳牵引所述重锤将所述取样管机构下放至海底后将牵引力释放。本申请提供的海底沉积层无扰动深尺度取样系统，结构简单合理，安装使用方便。取样时对海底底质样品扰动小，可以减少样品扰动或实现无扰动取样。取样深度大，每次取样时杆状重锤击打1‑2，一次取样长度可以控制在1m左右，如此往复，取样深度可达40m。样品长度可以通过记米组件实现自动计算。值得大面积推广使用。