本发明涉及一种基于瘤胃球菌微生物群的疾病风险预测方法及装置，获取肠道菌群相对丰度信息；确定样本分类变量数据；将肠道菌群特征数据和分类变量输入机器学习模型中进行训练，得到疾病风险预测模型；利用网格搜索算法进行参数调整；进行测试；进行性能评价；利用性能评价合格的疾病风险预测模型进行疾病风险预测。其优点在于，通过瘤胃球菌微生物群及样本相关信息可以对多种疾病风险进行预测，获取简单，不会对被检测者造成创伤；利用随机森林模型从复杂繁多的生物大数据中筛选用于预测多种疾病风险的、无创的生物标志物，提高预测准确率，弥补了不同疾病临床预警的空白；预测方法简单快捷，效率高，可以快速指引或辅助被检测人群进行后续处理。