本发明公开了一种多传变频系统及其制动控制方法、计算机存储介质。本发明公开的多传变频系统的制动控制方法包括并联连接的至少两个整流装置，确定当前整流装置的主从类型，在当前整流装置的主从类型为主机类型时，确定当前整流装置的制动指令，根据制动指令制动当前整流装置，并将制动指令发送给其他整流装置；在当前整流装置的主从类型为从机类型时，接收主从类型为主机类型的整流装置发送的制动指令，根据制动指令制动当前整流装置。本发明技术方案的主机类型的整流装置与从机类型的整流装置同步制动，以均匀分配多传变频系统的制动功率，避免制动功率大的整流装置先报故障，从而提高多传变频系统运行的稳定性。