本发明公开了一种抗凝血脱细胞真皮基质的制备方法。首先采用高碘酸钠对肝素进行氧化，制得含有交联活性醛基的双醛肝素，再将双醛肝素作为交联剂对脱细胞真皮基质进行化学修饰，制得抗凝血脱细胞真皮基质。该材料具有显著的抗凝血性能和抗血小板黏附性能，且抗凝血作用更温和，将其用于体内植入材料与人体血液直接接触时可以减少凝血、血小板减少和出血等并发症的发病率。此外，该材料还兼具良好的热稳定性、耐酶降解性和细胞相容性。可广泛用于组织工程心脏瓣膜、人工血管等抗凝支架材料的制备。