本发明公开了一种基于地球轨道的卫星集群控制方法和系统，涉及卫星集群领域。该方法包括：构建预设卫星集群的SDR坐标系，所述SDR坐标系与所述预设卫星集群的类型相对应，对所述预设卫星集群进行密度估算，获得密度估算结果，根据所述密度估算结果获得密度反馈控制参数，并结合所述SDR坐标系获得控制参量，根据所述控制参量对所述预设卫星集群进行控制，本方案通过密度反馈控制算法可以使大规模卫星集群均匀分布至目标区域，且可应对大量卫星的失效与大量新卫星的补充，在控制过程中还能避免卫星之间的碰撞。解决了圆轨道与椭圆轨道上的大规模卫星集群控制问题，本方案可解决数百颗卫星的集群控制问题，鲁棒性强，且保证每个卫星的安全。