本发明提供的一种基于速率分割的联合保密和隐蔽通信方法及系统，包括以下步骤：计算保密通信用户的保密通信速率；计算得到隐蔽通信用户的隐蔽通信速率；计算在满足保密通信，隐蔽通信以及功率限制的条件下，基站对应的功率分配系数；基站在预先约定好的时隙与隐蔽通信用户进行隐蔽通信，利用得到的功率分配系数，向隐蔽通信用户以及保密通信用户传送信息；本发明能够合理而灵活地利用基站功率资源，相比于未采用速率分割的方案，显著提升了系统传输速率，从而提高了联合保密和隐蔽通信要求下的频带利用率。