一种自动导引运输车磁导航控制系统，其属于自动导引运输车的技术领域。该控制系统包括通讯模块、电力电源模块、电机驱动控制模块、输出输入模块、开关检测控制模块、音频模块、磁导航模块、安全检测模块、单片机控制器。单片机控制器输出端对导航控制器进行节点触发,可以对AGV进行有效的定位控制,能够在预设的导航磁条上按行驶路线运行,设置检测避障传感器,在一定范围内检测前方障碍物并及时提供警报声,以提醒前后方人员。该控制系统不但可以实现AGV原有功能,而且可以满足现有小车小型化的需求;该控制器采用的电子元器件少,且为常见的电子元器件,还具有成本低的特点，同时可以满足多种应用场景。