本发明公开了一种基于谱聚类的染色质拓扑关联结构域预测方法及电子装置，使用Hi‑C数据中位点上下游的交互模式特征来进行谱聚类划分区域，并使用划分结果来对拓扑关联结构域区域进行预测；本发明将位点上下游2mb范围内的交互频次数据作为该位点的染色质相互作用模式特征，为后续模型提供更多有效的交互特征；引入余弦相似度量化位点之间相互作用模式的相似性，在聚类模型中具有更高的区分度，进而提高模型预测准确性；最后，在基准数据集上对本发明提出的方法进行评价，在预测精度方面优于现有技术，并在相关生物学数据进行验证，以证明本发明的有效性。