基于图卷积网络的miRNA和疾病关联关系预测方法
实质审查的生效
摘要
本发明公开一种基于图卷积网络的miRNA和疾病关联关系预测方法,主要包括:1、下载数据集,得到miRNA与疾病关联关系的矩阵A,计算miRNA、疾病的高斯相互作用属性核相似性KM、KD;2、下载miRNA的序列信息,计算miRNA序列相似性LM;3、计算改进的疾病语义相似性FD和miRNA基于疾病的功能相似性FM;4、将FM、LM和KM整合得到miRNA相似矩阵SM,将FD和KD整合得到疾病相似矩阵SD;5、整合SM、SD构建异构网络,将异构网络输入到图卷积网络中进行结构特征提取;采用主成分分析法对SM、SD进行属性特征提取;6、将属性特征和结构特征进行融合,采用随机森林分类器进行训练;7、使用5倍交叉验证方法对提出的方法进行验证;应用本发明预测miRNA和疾病的关联关系的精度高。
基本信息
专利标题 :
基于图卷积网络的miRNA和疾病关联关系预测方法
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN114496092A
申请号 :
CN202210122912.0
公开(公告)日 :
2022-05-13
申请日 :
2022-02-09
授权号 :
暂无
授权日 :
暂无
发明人 :
邝祝芳刘寄文贺御笔
申请人 :
中南林业科技大学
申请人地址 :
湖南省长沙市天心区韶山南路498号
代理机构 :
代理人 :
优先权 :
CN202210122912.0
主分类号 :
G16B35/20
IPC分类号 :
G16B35/20 G16B40/00 G16B50/00 G16H50/30 G06K9/62 G06N3/04 G06N3/08 G06N20/00
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学,例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B35/00
特别适用于核酸、蛋白质或肽计算机模拟组合表达库的ICT
G16B35/20
表达库筛选
法律状态
2022-05-31 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 35/20
申请日 : 20220209
申请日 : 20220209
2022-05-13 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
文件下载
暂无PDF文件可下载