一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法
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摘要

本发明公开了一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法,包括:S1、根据已知的LncRNA‑环境因素关联关系网络的邻接矩阵,分别计算出LncRNA的高斯相互作用属性核相似矩阵KL和环境因素的高斯相互作用属性核相似矩阵KE;S2、把KL和KE通过拉普拉斯算子进行归一化;S3、在LncRNA空间和环境因素空间中分别定义成本函数,通过最小化该成本函数,分别得到LncRNA空间和环境因素空间的最优分类器;S4、将得到的两种最优分类器转化为统一空间的分类器,用于计算LncRNA‑环境因素关联关系的概率,根据概率对LncRNA‑环境因素关联关系进行排名,概率值越高说明该LncRNA‑环境因素的关联关系越强。所述方法有效解决了生物实验方法的盲目性、成本高问题,对生物学家的实验研究起到了指导的作用。

基本信息
专利标题 :
一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN108427865A
申请号 :
CN201810209311.7
公开(公告)日 :
2018-08-21
申请日 :
2018-03-14
授权号 :
CN108427865B
授权日 :
2022-04-22
发明人 :
周杰徐展良
申请人 :
华南理工大学
申请人地址 :
广东省广州市天河区五山路381号
代理机构 :
广州市华学知识产权代理有限公司
代理人 :
李斌
优先权 :
CN201810209311.7
主分类号 :
G06F19/18
IPC分类号 :
G06F19/18  G06F19/24  
法律状态
2022-04-22 :
授权
2018-09-14 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : G06F 19/18
申请日 : 20180314
2018-08-21 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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