一种circRNA和miRNA关联关系高效预测方法
实质审查的生效
摘要
本发明公开一种circRNA和miRNA关联关系高效预测方法，包括如下步骤：1、下载circRNA、疾病与miRNA数据，构建circRNA与miRNA的邻接矩阵A；2、计算基于疾病和miRNA的circRNA高斯内核相似度矩阵CCIS和CMIS，计算circRNA的序列相似度矩阵CES；计算基于疾病和circRNA的miRNA高斯内核相似度矩阵MIS和MCIS；3、构建circRNA和miRNA的综合相似度矩阵CS和MS；4、基于Node2vec算法计算相似度矩阵CNS、MNS；5、分别把CNS、MNS与A拼接成特征矩阵CF、MF；6、基于0矩阵与邻接矩阵A构建异构邻接矩阵Acm；基于CF和MF构建异构特征矩阵CM；7、把异构邻接矩阵Acm与CM嵌入图注意力网络，基于talking‑heads与条件随机场算法进行编码，再通过完全矩阵分解算法进行解码得出最终得分矩阵进行预测。本发明是一种新的预测circRNA与miRNA关联方法。
基本信息
专利标题 ：
一种circRNA和miRNA关联关系高效预测方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114496084A
申请号 ：
CN202210119428.2
公开（公告）日 ：
2022-05-13
申请日 ：
2022-02-08
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
邝祝芳马志豪张宇豪
申请人 ：
中南林业科技大学
申请人地址 ：
湖南省长沙市天心区韶山南路498号
代理机构 ：
代理人 ：
优先权 ：
CN202210119428.2
主分类号 ：
G16B30/00
IPC分类号 ：
G16B30/00 G16B40/00 G16B50/00 G06K9/62
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B30/00
特别适用于对核酸或氨基酸进行序列分析的ICT
法律状态
2022-05-31 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 30/00
申请日 : 20220208
申请日 : 20220208
2022-05-13 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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