本申请涉及一种确定透明体表面缺陷所在层面的方法及系统，其包括如下步骤：分别拍摄透明体的第一表面和第二表面，分别获得对应的第一缺陷图像和第二缺陷图像，拍摄两个表面时成像装置的镜头朝向不平行；对比两个缺陷图像对应区域的缺陷位置，并结合所述成像装置的镜头俯仰角，确定出所述透明体上的缺陷所在层面，其中，所述镜头俯仰角为所述成像装置的镜头朝向与所述透明体的运动方向之间的夹角。本申请可以解决相关技术中通常的机器视觉在检测过程中仅靠镜头的景深不足以明显区分出缺陷所在的玻璃层面的问题。