本发明提供一种柔性表面增强拉曼基底及其制备方法，涉及表面增强拉曼光谱基底制备技术领域，所述的柔性表面增强拉曼基底的制备方法，包括以下步骤：S101：将表面导电的有机聚合物薄膜作为电沉积的基底，使用电解质溶液，在其表面进行贵金属纳米结构的电沉积制备，制得产物；S102：将步骤S101制得的产物在纯水中洗净，获得贵金属纳米结构与有机聚合物复合的柔性表面增强拉曼基底。本发明提供的制备方法具有制备过程简单、实际应用方便的特点。本发明提供的制备方法制得的银纳米树枝‑聚苯乙烯‑聚丁二烯‑聚苯乙烯柔性表面增强拉曼基底具有优异的拉曼检测性能，且灵敏度高、重现性好，可有效用于食品中添加剂或者农药的检测。