本发明公开了一种兼顾高稳定性和高拉曼强度的表面增强拉曼基底及其制备方法，属于分子识别和纳米制备领域，针对常规技术中稳定性与拉曼信号强度无法同时满足的难点，提出了一种创新的兼顾稳定性与拉曼强度的表面增强拉曼基底及制备方法。本发明使用具有纳米间隙的银枝晶结构，使用原子层沉积在金属纳米间隙之间引入均匀的纳米级厚度的氧化物，精确控制厚度，在完全包裹银的前提下，不填满纳米间隙，以此制备超薄氧化物包裹的银纳米枝晶结构。此结构中的保护层不仅可以稳定金属银基底，还可以引入额外的化学增强效果，同时提高了SERS基底的稳定性与拉曼信号强度，使得超薄氧化物包裹的银纳米枝晶结构同时具备高稳定性与高拉曼信号强度。