本发明提出了一种富含氨基酸的五谷酵粉及其制备方法，属于酵素技术领域，将黄豆、白芸豆、黑豆、绿豆、红豆预处理后浸泡在EDTA二钠溶液中，然后经过化学处理，得到脱毒五谷粉，进一步经过酶解、多次发酵处理后，经过滤压榨，收集滤液，干燥，粉碎，得到富含氨基酸的五谷酵粉。本发明采用超声波辅助、螯合剂反应以及化学+物理方法去除五谷粉中的重金属、农残以及抗营养因子，进一步通过复合酶酶解，促进五谷粉的分解，去除细胞壁，促进营养物质的溶出，复合微生物菌液进行多次发酵，提高游离氨基酸、维生素、微量元素、以及生物活性化合物等的含量，进一步改善口感和营养，经过后处理后，得到便于储存和运输的五谷酵粉，具有广阔的应用前景。