本发明公开了一种采用红外长波焦平面探测器的干涉信号去噪方法。通过红外焦平面探测器和迈克尔逊干涉仪搭建的傅里叶光谱仪采集得到干涉信号。用卡尔曼滤波算法对探测器每一探测元每一时刻的输出进行滤波处理，然后再对每一段滤波结果值求平均，进一步滤除其他噪声；最后排序重构成干涉图。整个去噪方法简单易行，相比于之前直接对多组光谱数据求均值来提高光谱信噪比的方法，该方法在干涉图傅里叶变化成光谱图之前，对干涉信号中的噪声进行抑制，可进一步滤除随机噪声并保留原始光谱特征。为未来采用长波焦平面探测器的傅里叶光谱仪干涉信号处理提供技术基础。