本发明提出一种基于透射电镜支持膜进行双样品制备的方法，采用配套制样台搭配载网支持膜进行双样品制备；使用所述配套制样台进行透射电镜载网支持膜双样品制备时，将载网支持膜正面朝上放置于底座凹槽中，压板通过定位柱与底座凹槽配合，使压板底部盖在载网支持膜上，压板将支持膜区隔出两个独立制样区域；两个样品都制备完毕，采用细小尖锐物沿着压板第一个制样区域的圆周边缘，等距将支持膜刺出三个标识孔；通过三个所述标识孔进行两个不同制样区域的定位。其制样方法简单易行，并能有效地对不同的样品区域进行定位，大大提高了透射电镜的测试效率。