本发明公开了一种磁场目标定位系统和方法。根据本发明的磁场目标定位系统包括：磁场生成控制模块，用于生成控制磁场发生的信号；磁场发生装置，根据所述磁场生成控制模块生成的信号，在空间中产生磁场；目标定位装置，处于所述磁场发生装置所产生的磁场中，产生磁感应信号；信号采集模块，用于采集所述目标定位装置处所产生的磁感应信号；定位计算模块，根据所述磁场信号采集模块所采集的磁感应信号，计算所述目标定位装置的位置和方向。本发明的目标定位技术可以用于医疗手术中，特别是介入类手术中，能够在不过多占用目标物尺寸的情况下，尽量保证定位的精度。本发明提出的更普遍适用的定位计算方法不用将励磁线圈横截面限定为圆形。