本发明提供一种基于影响力超图的晚期轻度认知障碍风险预测系统及产品，其中系统包括处理子系统和风险预测子系统，风险预测子系统包括初始超图生成单元、生成器、相似性获取单元和风险预测单元；初始超图生成单元根据患者的脑区图像和基因数据得到其初始脑区‑基因超图；生成器用于对初始脑区‑基因超图进行设定次数的影响力传播，以得到预测脑区‑基因超图；相似性获取单元根据预测脑区‑基因超图与初始的脑区‑基因超图之间的相似性、预测脑区‑基因超图与LMCI的脑区‑基因超图之间的相似性；风险预测单元根据上述相似性预测患者是否有演变晚期轻度认知障碍风险。本发明提供的技术方案能够提高预测晚期轻度认知障碍风险的准确性。