本实用新型隔离阀结构包括有一套筒、一上端盖及一下端盖，主要在套筒的内部套设有一衬环，以及于衬环顶部设有一阀瓣，此衬环的外围以及底部分别设有若干定位用凸条，使衬环与套筒内壁以及下端盖保持特定之间隔；尤其，衬环于主通孔外围设有滑槽，阀瓣周边则具有可配合穿入滑槽中滑移的穿轴，主要因隔离阀两侧压力的不同，使阀瓣得以压贴于上端盖，进而将上端盖的管路接口遮蔽，或使阀瓣藉由穿轴滑入衬环的滑槽中以离开上端盖，并且于使用时因该穿轴可完全没入滑槽中，排除因废材堆积而影响阀瓣的滑动状态。