本发明涉及图像处理技术领域，具体公开了一种基于端到端卷积神经网络的证件照抠图方法，其中，包括：将证件人像照片的抠图蒙版中的前景图与互联网照片进行合成得到训练图像；根据轻量级语义分割网络模型生成粗分割Trimap图网络；根据编解码网络对粗分割Trimap图网络进行精细化抠图，得到精细化抠图网络；将粗分割Trimap图网络和精细化抠图网络进行级联，得到端到端网络模型；将训练图像输入端到端网络模型进行微调，得到完成训练的端到端网络模型。本发明还公开了一种基于端到端卷积神经网络的证件照抠图系统、存储介质及处理器。本发明提供的基于端到端卷积神经网络的证件照抠图方法能够自动对证件照得到对应的抠图前景，无需人工标注，提高了抠图效率。