本实用新型公开了一种通过脉冲补气电子轰击电离源串联离子阱质谱装置。电子轰击电离源具有很高的电离效率，常用于串联四级杆、离子阱、飞行时间等各种质量分析器。离子阱是一种适用于低真空度的质量分析器，适当的高气压下对于离子阱的离子冷却，分辨率和灵敏度提高有很大的作用。所以为了解决两者串联使用时的矛盾，本实用新型发展了一种用于通过脉冲补气提高电子轰击电离源串联离子阱质谱灵敏度的方法。装置主要包括矩形离子阱，EI电离源，静电透镜系统，脉冲补气装置，真空泵系统。本实用新型本质上是实现了高真空下的EI源和低真空下矩形离子阱的联合使用，提高了离子阱的离子捕获效率，进而提高仪器的灵敏度一个数量级。