本发明公开了一种基于行人自动轨迹导航的融合数据处理系统，包括室内行人自动轨迹导航单元，用于实现室内行人的第一轨迹导航的自动化识别处理和第一轨迹导航数据的提供；地铁轻轨自动轨迹导航单元，用于实现室内行人的第二轨迹导航的自动化识别处理和第二轨迹导航数据的提供；数据采集单元，用于在轨迹导航过程中检测数据的实时采集；数据解析适配单元，用于对各数据进行解析处理；融合数据处理应用单元，用于将解析后的数据进行关联和分段处理，并根据分段的结果展示对应的轨迹导航图；其有益效果是：利用对室内行人、地铁轻轨轨迹导航数据和采集数据的解析与关联匹配，实现行人在室内和地铁轻轨场景下对多种行人轨迹导航数据的融合处理。