本发明公开了一种基于主从电荷泵结构的反熔丝编程控制电路，涉及反熔丝技术领域，该电路中，主电荷泵模块获取外部电压并连接各个从电荷泵模块，每个从电荷泵模块连接一个反熔丝阵列，且每个从电荷泵模块的布局位置与所连接的反熔丝阵列的布局位置不超过预定距离，反馈网络根据每个从电荷泵模块输出给所连接的反熔丝阵列的编程电压、输出从电荷泵模块对应的反馈信号给主电荷泵模块，主电荷泵模块根据每个从电荷泵模块对应的反馈信号调节提供给从电荷泵模块的主驱动信号以稳定从电荷泵模块输出的编程电压；该电路可以给反熔丝阵列提供精准的编程电压，有利于提高反熔丝编程后的电阻值的一致性，优化性能。