本发明公布一种行走马达保护控制系统，属于工程机械技术领域。油泵组件出油口分别连接有第一控制阀和第二控制阀；第一控制阀控制连接左行走马达，第二控制阀控制连接右行走马达；控制器电连接油泵组件；油泵组件包括第一变量泵和第二变量泵；第一变量泵出油口连接第一控制阀和第三控制阀；第二变量泵连接所述第三控制阀，第三控制阀出油口连接所述第二控制阀；第三控制阀与控制器电连接。本发明通过监控行走马达的转速和连续使用时间两个变量，控制器内部逻辑运算分析关键因子达到影响行走马达寿命时自动停止工作；针对性的分析行走马达在不同工作下的行走马达转速和连续使用时间，对行走马达的保护限定控制更加精准，提高其工作效率。