本实用新型涉及样品光学检测领域，具体地说是高效双通路圆偏振荧光光谱测量系统，其中白光光源、被测样品、物镜、二向色镜、可移动反射镜、1/4波片、50:50分束镜、格兰棱镜、高通滤波片、聚焦镜和Y型光纤输入端头依次呈一线排列，显微成相时，可移动反射镜二移入系统，圆偏振荧光光谱测量时，可移动反射镜二移出系统，激发光源出射的连续激光经退偏器退偏为自然光，自然光经二向色镜反射与物镜聚焦至被测样品，被测样品受激发辐射圆偏振荧光，圆偏振荧光经1/4波片转化为线偏振荧光，线偏振荧光经过圆偏振荧光采集模块入射至荧光光谱采集系统。本实用新型可以同时对被测样品进行左旋圆偏振荧光与右旋圆偏振荧光进行采集，极大提升系统效率。