本发明涉及温度控制技术领域，公开一种组织脱水机温度控制方法、系统、设备及介质。该方法包括：采集在共振加热装置以第一加热功率作用下处理缸内试剂的温度；计算当前脱水流程的目标阈值温度；判断实时试剂温度是否在第一预设等待时长内超过当前脱水流程的目标阈值温度；若是，控制共振加热装置以第二加热功率进行加热以及计算加热补偿时长；确定关闭共振加热装置的目标等待时长；当实际等待时长到达目标等待时长时，关闭共振加热装置。本发明在脱水试剂达到温度阈值后动态地调节降低后的加热功率以及对降低加热功率的程度动态补偿加热时长，避免加热时长不够而影响脱水效果。