本发明提供一种磁共振成像引导手术机器人方法及系统，所述方法包括以下步骤：通过不同组织的弛豫时间的不同，获取不同对比度的图像；通过读出梯度磁场和相位梯度场的切换获得填充K空间的数据，通过空间坐标三个方向施加不同梯度磁场，通过所述梯度磁场大小和接收带宽调节，确定采集区的层的厚度；获得填充K空间的数据，抵消感生磁场的干扰；K空间数据变换生成实时磁共振成像，磁共振成像进行FFT图像处理引导手术机器人介入所述磁共振成像的位置。本发明通过磁共振成像图像处理的算法设计引导手术机器人，具有响应时间小，灵敏度高，分辨率高，高精度，硬件设备安全性高，软件系统强鲁棒性、高稳定性，以及优良的人机化设计。