本发明涉及有机功能材料图案化领域，公开了一种超高精度有机功能材料图案化的印刷制备方法，包括如下步骤：1）“两段式”印刷分子的设计与合成；2）具有图案化结构的下基材及表面平整的上基材的浸润性调控；3）将上、下基材组装形成“三明治”结构；4）填充含有微气泡及印刷分子的组装液，并形成预设图案的气泡阵列；5）干燥后分离上、下基材。本发明利用演化受控的气泡阵列作为模板，借助气泡壁空间对于液体及液体中所含有机功能分子的软限域作用，通过连续的气泡排液、干燥过程，最终实现在任意基材表面印刷最高精度可达数十纳米的有机功能材料图案。本发明方法简单，精度及形貌可控性好，图案中分子纯度高，有望实现分子电路的印刷制备。