一种miRNA和药物耐药性关联的高效预测方法
实质审查的生效
摘要
本发明公开一种miRNA和药物耐药性关联的高效预测方法，主要包括以下步骤：1、下载数据集，得到miRNA、药物的列表，和关联矩阵A；计算miRNA和药物的高斯相互作用属性核相似矩阵GSM、GSD；2、计算miRNA之间的序列相似性矩阵SSM，计算药物之间的化学结构相似性ESD；3、利用GSM和SSM构建miRNA的相似矩阵SM；且利用GSD和ESD构建药物的相似矩阵SD；4、融合A、SM和SD构建一个全局异构网络G；利用倾斜重启随机游走计算扩散特征，并使用奇异值分解降维；5、计算miRNA‑药物对的Hetesim得分；6、结合扩散特征和HeteSim得分得到特征数据集，训练支持向量机分类器去预测miRNA‑药物的关联关系；7、使用10折交叉验证方法进行验证；应用本发明预测miRNA和药物耐药性关联关系的精度高。
基本信息
专利标题 ：
一种miRNA和药物耐药性关联的高效预测方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114550814A
申请号 ：
CN202210153772.3
公开（公告）日 ：
2022-05-27
申请日 ：
2022-02-19
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
邝祝芳段涛赵鹏
申请人 ：
中南林业科技大学
申请人地址 ：
湖南省长沙市天心区韶山南路498号
代理机构 ：
代理人 ：
优先权 ：
CN202210153772.3
主分类号 ：
G16B15/30
IPC分类号 ：
G16B15/30 G16B30/10 G16B40/20 G16B50/30 G06K9/62
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B15/00
特别适用于分析二维或三维分子结构，例如结构或功能关系、结构排序的ICT
G16B15/30
利用结构数据进行药物靶向;对接或绑定预测
法律状态
2022-06-14 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 15/30
申请日 : 20220219
申请日 : 20220219
2022-05-27 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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