本发明公开一种混合动力车辆热管理系统控制方法、装置及存储介质，涉及混合动力汽车技术领域。混合动力车辆热管理系统控制方法包括以下步骤：获取混合动力车辆的驱动模式，其中，驱动模式用于表征驱动混合动力车辆的动力部件，动力部件包括动力电池、发动机或者驱动电机的至少之一；分别获取多个动力部件在驱动模式下的冷却液出口温度和预设热交换温度，并分别根据动力部件的冷却液出口温度与对应的预设热交换温度确定工作模式；根据工作模式控制热管理系统中热交换介质的流动方向，以对热管理系统中的动力部件进行冷却或者预热。本申请能够使混合动力车辆提高工作效率的同时减少安全隐患。