本发明公开了一种印刷电路板的缺陷定位设备、定位方法及光学检测系统，设备具有放置目标电路板的平台、向平台投影的投影装置以及向平台采集图像信息的摄像装置；设备的控制装置获取目标电路板预扫描的第一图像以及预判缺陷在第一图像上的位置信息，以及通过摄像装置获取目标电路板放置在平台上的第二图像；根据第二图像对第一图像进行标定，以计算出第一图像中的电路板相对于第二图像中的电路板的方位信息；根据方位信息对预判缺陷在第一图像上的位置信息进行转换，并对其进行投影。本发明可以不限定目标电路板的形状及放置在平台上的姿态角度，而对目标电路板上的缺陷进行准确投影。