本发明公开了一种基于图像考种的种子尺寸标定方法、系统及装置，方法包括：获取带有标识刻度线的考种标定物的有效二值图；依次遍历有效二值图中所有连通域进行二次筛选形成第二有效刻度线集合；分别将同列的第二有效刻度线放在一个集合内，分别对每个第二有效刻度线集合内的第二有效刻度线进行筛选得到第三有效刻度线集合；得到与考种标定物边的数目相同的交点，基于交点的位置变化进行旋转及透视变换得到校正图像并判断像素与考种标定物实际尺寸的对应关系，得到单位像素的实际尺寸。本发明自动将图像的像素距离和实际尺寸对应起来，不仅解决图像倾斜照成的误差，还取代了人工标定像素尺寸的工作，节省了人力成本，提高了工作效率。