基于样本数据预测蛋白质复合物的方法
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摘要
本发明涉及基于样本数据预测蛋白质复合物的方法。该方法包括:(1)基于所述样本数据构建加权PPI网络并将所述加权PPI网络进行去噪处理,所述去噪处理是通过将基因本体的语义相似度作为PPI网络的权重进行加权的;(2)基于去燥处理后的加权PPI网络构建动态加权PPI网络;(3)利用混合聚类算法预测蛋白质复合物。该方法通过GO语义相似度的引进有效地降低了PPI数据的噪声,并且具有了生物学的意义;同时,反映了真实的蛋白质活动,体现了PPI网络的动态性;另外,改善了传统聚类算法中过拟合或欠拟合的缺陷,提高了聚类算法的准确率,进而有效地提高了蛋白质复合物预测结果的准确性。
基本信息
专利标题 :
基于样本数据预测蛋白质复合物的方法
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN108681659A
申请号 :
CN201810283299.4
公开(公告)日 :
2018-10-19
申请日 :
2018-04-02
授权号 :
CN108681659B
授权日 :
2022-04-05
发明人 :
刘丽珍孙晓武宋巍
申请人 :
首都师范大学
申请人地址 :
北京市海淀区西三环北路105号
代理机构 :
北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人 :
赵天月
优先权 :
CN201810283299.4
主分类号 :
G06F19/24
IPC分类号 :
G06F19/24 G06F19/18
法律状态
2022-04-05 :
授权
2018-11-13 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : G06F 19/24
申请日 : 20180402
申请日 : 20180402
2018-10-19 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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