本发明公开了一种飞行器智能轨迹重构再入制导方法，包括根据飞行器再入初始状态和各类约束条件，采用数值优化方法生成一条离线参考轨迹；设置航路点，计算相应的可达域；通过最优轨迹滚转角变化的特点，设置5个归一化参数建立最优轨迹和滚转角的联系，提出利用搜索算法求解相应滚转角参数的优化方法，然后在可达域内选取样本数据点，离线计算训练数据并基于BP神经网络进行训练；采用制导方法跟踪参考轨迹；到达航路点高度时，利用训练好的神经网络模型生成新的轨迹；完成轨迹重构，飞行器跟踪新的轨迹，继续完成再入制导。本发明方法极大地减小轨迹重构的计算时间，降低优化时间对制导性能的影响，以进一步改善再入飞行器在再入段的制导精度。