本发明公开了一种基于抗混叠语义重构的小样本语义分割方法，所述方法包括训练部分和测试部分，其中，所述训练部分包括以下步骤：步骤1，对支撑图片和查询图片进行特征提取；步骤2，对属于不同基类的特征进行语义张成；步骤3，滤除干扰语义，实现对目标类别的分割。本发明公开的基于抗混叠语义重构的小样本语义分割方法，降低了数据标注成本，减少了语义混叠，增强了模型判别力。本发明还公开了一种小样本语义分割系统、计算机可读存储介质和计算机设备。