本发明公开了一种基于随机厚度液态掩模的加密辐射成像系统，包括X射线源、待检测物品、液态金属掩模、掩模内部厚度控制阵列和X射线探测器，本发明通过掩模内部厚度控制阵列对液态掩模的厚度进行随机调节，实现对穿透掩模的X射线进行随机衰减，进而将X射线成像中携带的敏感信息加密，有效保护了待检物品的敏感信息，实现了对射出粒子的能量和位置信息采用物理屏蔽的加密措施，提出的安全检查技术从物理领域加密出射X射线所携带的信息，避免了隐私信息被泄露的风险，且不会暴露待检物品的任何隐私信息，采用模板对比法，方便确认待检物品中是否包含违禁品，实现了在保护被检物品敏感信息的基础上进行安全检查。