本发明涉及一种永磁式集群磁流变抛光机构及抛光方法。包括机架、公转机构、自转机构、装夹头、抛光盘、磁场发生机构；其中，磁场发生机构包括安装座、多个径向充磁的柱形的第一永磁体、多个轴向充磁的第二永磁体、多个轴向充磁的第三永磁体；每一个第二永磁体的四周均间隔安装有多个第三永磁体，以共同组成一个永磁块；多个永磁块阵列安装于安装座的顶部，第二永磁体和第三永磁体朝向抛光盘的一端的磁极分别是N极和S极；安装座上间隔设有多个安装腔，多个第一永磁体分别横向且转动安装于多个安装腔中，转动第一永磁体，能够在抛光盘中形成磁场或使磁场消退。本发明通过转动第一永磁体，可实现充磁和消磁，便于抛光盘的清理。