本申请提出了一种基于荧光光谱的分类方法，包括：获取多个目标的荧光光谱矩阵；计算每两荧光光谱矩阵之间的相似度；根据所有相似度构建对应所有目标的相似度矩阵，并根据相似度矩阵获取度矩阵；根据相似度矩阵和度矩阵获取标准拉普拉斯矩阵；获取标准拉普拉斯矩阵的至少一特征值及每一特征值对应的特征向量；根据所有特征向量构建特征矩阵，并根据特征矩阵每行的所有元素构建对应的聚类样本；将所有聚类样本进行聚类得到聚类结果，根据聚类结果将多个目标进行分类。该方法通过基于目标的荧光光谱得到荧光光谱矩阵，通过每两荧光光谱矩阵之间的相似度构建相似度矩阵，引入谱聚类的方法进行聚类分析，实现了基于荧光光谱对目标进行分类。