本申请公开了精子质量分析装置、系统、方法及可读存储介质，精子质量分析装置，包括显微图像扫描系统、处理器和温控系统；精子质量分析系统，包括自动物镜转换系统、自动移动平台、相衬成像识别系统和图像处理系统和恒温控制系统；基于深度学习的精子形态分类系统以预处理形态学图片为输入，完成精子形态学识别与分类的工作，图像预处理先对图像的目标精子进行有选择地处理以改善图像的视觉效果，转变为更适合于分析仪处理的形式；然后处理器分别对精子进行精子动力学分析、精子形态学分析和精子DNA损伤分析；实现全自动精子形态学分析和精子DNA损伤分析的一体化。