本发明公开了基于多点扩散函数生成对抗网络的大景深成像方法及系统，包括以下步骤：步骤1：构建基于自动聚焦的多聚焦成像模型；步骤2：获取小景深多聚焦图像和大景深真值图像，构建数据集；步骤3：构建基于生成对抗网络的图像重建网络模型；步骤4：根据步骤2得到的数据集，对步骤3得到的网络模型进行训练；训练过程中基于反向传播梯度下降算法最小化损失函数；步骤5：将多聚焦图像输入步骤4得到的网络模型，即可得到重建的大景深图像；本发明具有简单、灵活、低成本的优点，缓解了景深与信噪比的之间制衡，提高了成像质量，能够满足各类场景的大景深成像需求。